Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 MIR4509-3-201ENST00000578671 94 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.07□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC0.07□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC0.07□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC0.07□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC0.07□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 AC010608.3-201ENST00000625048 527 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 RNU6-1000P-201ENST00000391066 106 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC0.06□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC0.06□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.06□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC0.06□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC0.06□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC0.06□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 MTND4P33-201ENST00000556706 766 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC0.06□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC0.05□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC0.05□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CHD3Q12873 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
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