Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.61□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CNTN1Q12860 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
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