Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
BPTFQ12830 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
BPTFQ12830 AL355994.1-201ENST00000424379 260 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
BPTFQ12830 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC-0.88□□□□□ -2.55
BPTFQ12830 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
BPTFQ12830 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
BPTFQ12830 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
BPTFQ12830 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
BPTFQ12830 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
BPTFQ12830 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
BPTFQ12830 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC-0.88□□□□□ -2.55
BPTFQ12830 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
BPTFQ12830 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
BPTFQ12830 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
BPTFQ12830 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
BPTFQ12830 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
BPTFQ12830 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
BPTFQ12830 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
BPTFQ12830 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
BPTFQ12830 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
BPTFQ12830 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
BPTFQ12830 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
BPTFQ12830 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC-0.89□□□□□ -2.55
BPTFQ12830 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
BPTFQ12830 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
BPTFQ12830 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC-0.89□□□□□ -2.55
BPTFQ12830 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
BPTFQ12830 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
BPTFQ12830 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
BPTFQ12830 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
BPTFQ12830 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-0.89□□□□□ -2.55
BPTFQ12830 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
BPTFQ12830 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
BPTFQ12830 AL020997.3-201ENST00000602843 359 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
BPTFQ12830 MIR548H1-201ENST00000408610 102 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
BPTFQ12830 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
BPTFQ12830 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
BPTFQ12830 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC-0.89□□□□□ -2.55
BPTFQ12830 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
BPTFQ12830 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
BPTFQ12830 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC-0.89□□□□□ -2.55
BPTFQ12830 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
BPTFQ12830 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
BPTFQ12830 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
BPTFQ12830 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
BPTFQ12830 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
BPTFQ12830 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
BPTFQ12830 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
BPTFQ12830 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC-0.9□□□□□ -2.55
BPTFQ12830 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC-0.9□□□□□ -2.55
BPTFQ12830 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC-0.9□□□□□ -2.55
BPTFQ12830 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
BPTFQ12830 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
BPTFQ12830 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
BPTFQ12830 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
BPTFQ12830 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-0.9□□□□□ -2.55
BPTFQ12830 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
BPTFQ12830 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-0.9□□□□□ -2.55
BPTFQ12830 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
BPTFQ12830 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
BPTFQ12830 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.91□□□□□ -2.55
BPTFQ12830 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
BPTFQ12830 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
BPTFQ12830 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
BPTFQ12830 AL354692.1-201ENST00000423044 315 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
BPTFQ12830 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
BPTFQ12830 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC-0.91□□□□□ -2.55
BPTFQ12830 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
BPTFQ12830 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
BPTFQ12830 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC-0.91□□□□□ -2.55
BPTFQ12830 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC-0.91□□□□□ -2.55
BPTFQ12830 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC-0.91□□□□□ -2.55
BPTFQ12830 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
BPTFQ12830 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
BPTFQ12830 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
BPTFQ12830 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
BPTFQ12830 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
BPTFQ12830 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
BPTFQ12830 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
BPTFQ12830 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.91□□□□□ -2.56
BPTFQ12830 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
BPTFQ12830 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC-0.92□□□□□ -2.56
BPTFQ12830 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
BPTFQ12830 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC-0.92□□□□□ -2.56
BPTFQ12830 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC-0.92□□□□□ -2.56
BPTFQ12830 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
BPTFQ12830 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
BPTFQ12830 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
BPTFQ12830 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC-0.92□□□□□ -2.56
BPTFQ12830 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
BPTFQ12830 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
BPTFQ12830 VN1R88P-201ENST00000596787 292 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
BPTFQ12830 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
BPTFQ12830 AL118556.2-201ENST00000614375 824 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
BPTFQ12830 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
BPTFQ12830 Y_RNA.502-201ENST00000384478 113 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
BPTFQ12830 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
BPTFQ12830 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
BPTFQ12830 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
BPTFQ12830 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
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