Protein–RNA interactions for Protein: Q12766

HMGXB3, HMG domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB3Q12766 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
HMGXB3Q12766 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
HMGXB3Q12766 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
HMGXB3Q12766 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
HMGXB3Q12766 AL445435.1-201ENST00000604232 665 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
HMGXB3Q12766 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.6□□□□□ -2.51
HMGXB3Q12766 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
HMGXB3Q12766 AC010468.3-201ENST00000508225 458 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
HMGXB3Q12766 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
HMGXB3Q12766 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
HMGXB3Q12766 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC-0.6□□□□□ -2.51
HMGXB3Q12766 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
HMGXB3Q12766 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
HMGXB3Q12766 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
HMGXB3Q12766 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
HMGXB3Q12766 MIR16-2-201ENST00000362117 81 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
HMGXB3Q12766 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
HMGXB3Q12766 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
HMGXB3Q12766 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
HMGXB3Q12766 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
HMGXB3Q12766 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
HMGXB3Q12766 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
HMGXB3Q12766 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
HMGXB3Q12766 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
HMGXB3Q12766 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
HMGXB3Q12766 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
HMGXB3Q12766 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
HMGXB3Q12766 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
HMGXB3Q12766 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
HMGXB3Q12766 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
HMGXB3Q12766 AC093875.1-201ENST00000623688 504 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
HMGXB3Q12766 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
HMGXB3Q12766 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
HMGXB3Q12766 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
HMGXB3Q12766 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
HMGXB3Q12766 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
HMGXB3Q12766 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
HMGXB3Q12766 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
HMGXB3Q12766 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
HMGXB3Q12766 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
HMGXB3Q12766 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
HMGXB3Q12766 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
HMGXB3Q12766 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
HMGXB3Q12766 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
HMGXB3Q12766 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
HMGXB3Q12766 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
HMGXB3Q12766 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
HMGXB3Q12766 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
HMGXB3Q12766 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
HMGXB3Q12766 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
HMGXB3Q12766 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
HMGXB3Q12766 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
HMGXB3Q12766 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
HMGXB3Q12766 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
HMGXB3Q12766 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
HMGXB3Q12766 RNU6-180P-201ENST00000516697 61 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
HMGXB3Q12766 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
HMGXB3Q12766 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
HMGXB3Q12766 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
HMGXB3Q12766 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
HMGXB3Q12766 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
HMGXB3Q12766 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
HMGXB3Q12766 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
HMGXB3Q12766 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
HMGXB3Q12766 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
HMGXB3Q12766 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
HMGXB3Q12766 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
HMGXB3Q12766 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
HMGXB3Q12766 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
HMGXB3Q12766 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
HMGXB3Q12766 RNA5SP461-201ENST00000516451 104 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
HMGXB3Q12766 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
HMGXB3Q12766 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
HMGXB3Q12766 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
HMGXB3Q12766 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
HMGXB3Q12766 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
HMGXB3Q12766 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
HMGXB3Q12766 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
HMGXB3Q12766 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
HMGXB3Q12766 Y_RNA.616-201ENST00000410835 95 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
HMGXB3Q12766 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
HMGXB3Q12766 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
HMGXB3Q12766 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
HMGXB3Q12766 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
HMGXB3Q12766 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
HMGXB3Q12766 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
HMGXB3Q12766 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
HMGXB3Q12766 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
HMGXB3Q12766 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC-0.65□□□□□ -2.51
HMGXB3Q12766 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
HMGXB3Q12766 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
HMGXB3Q12766 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
HMGXB3Q12766 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
HMGXB3Q12766 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
HMGXB3Q12766 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
HMGXB3Q12766 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
HMGXB3Q12766 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC-0.65□□□□□ -2.51
HMGXB3Q12766 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC-0.65□□□□□ -2.51
HMGXB3Q12766 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
HMGXB3Q12766 AC104072.1-201ENST00000568817 668 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
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