Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
CENPEQ02224 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CENPEQ02224 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CENPEQ02224 MIR7-1-201ENST00000384871 110 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CENPEQ02224 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CENPEQ02224 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC-1.35□□□□□ -2.63
CENPEQ02224 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CENPEQ02224 LINC01851-201ENST00000443419 637 ntTSL 3 BASIC-1.35□□□□□ -2.63
CENPEQ02224 AL008723.1-201ENST00000452181 590 ntTSL 5 BASIC-1.35□□□□□ -2.63
CENPEQ02224 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CENPEQ02224 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CENPEQ02224 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CENPEQ02224 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CENPEQ02224 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC-1.35□□□□□ -2.63
CENPEQ02224 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CENPEQ02224 SNORD115-33-201ENST00000363723 82 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CENPEQ02224 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CENPEQ02224 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CENPEQ02224 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CENPEQ02224 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CENPEQ02224 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CENPEQ02224 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CENPEQ02224 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CENPEQ02224 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CENPEQ02224 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
CENPEQ02224 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
CENPEQ02224 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
CENPEQ02224 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
CENPEQ02224 AL158053.1-201ENST00000441503 453 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
CENPEQ02224 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
CENPEQ02224 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC-1.36□□□□□ -2.63
CENPEQ02224 MTND2P17-201ENST00000550281 688 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
CENPEQ02224 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC-1.36□□□□□ -2.63
CENPEQ02224 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
CENPEQ02224 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
CENPEQ02224 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
CENPEQ02224 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
CENPEQ02224 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC-1.36□□□□□ -2.63
CENPEQ02224 AC015727.1-201ENST00000572792 512 ntTSL 5 BASIC-1.36□□□□□ -2.63
CENPEQ02224 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
CENPEQ02224 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC-1.37□□□□□ -2.63
CENPEQ02224 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC-1.37□□□□□ -2.63
CENPEQ02224 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
CENPEQ02224 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
CENPEQ02224 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.37□□□□□ -2.63
CENPEQ02224 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
CENPEQ02224 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
CENPEQ02224 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
CENPEQ02224 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
CENPEQ02224 AC091917.1-201ENST00000506330 566 ntTSL 4 BASIC-1.37□□□□□ -2.63
CENPEQ02224 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
CENPEQ02224 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
CENPEQ02224 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
CENPEQ02224 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
CENPEQ02224 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
CENPEQ02224 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
CENPEQ02224 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
CENPEQ02224 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC-1.38□□□□□ -2.63
CENPEQ02224 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC-1.38□□□□□ -2.63
CENPEQ02224 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
CENPEQ02224 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
CENPEQ02224 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
CENPEQ02224 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
CENPEQ02224 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC-1.38□□□□□ -2.63
CENPEQ02224 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
CENPEQ02224 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
CENPEQ02224 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
CENPEQ02224 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
CENPEQ02224 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
CENPEQ02224 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
CENPEQ02224 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
CENPEQ02224 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
CENPEQ02224 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
CENPEQ02224 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
CENPEQ02224 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
CENPEQ02224 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
CENPEQ02224 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
CENPEQ02224 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
CENPEQ02224 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
CENPEQ02224 FO393419.3-201ENST00000428741 282 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
CENPEQ02224 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
CENPEQ02224 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
CENPEQ02224 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC-1.39□□□□□ -2.63
CENPEQ02224 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
CENPEQ02224 AC073641.1-201ENST00000425192 429 ntTSL 3 BASIC-1.39□□□□□ -2.63
CENPEQ02224 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
CENPEQ02224 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
CENPEQ02224 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
CENPEQ02224 RNU6-987P-201ENST00000384759 104 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
CENPEQ02224 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
CENPEQ02224 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
CENPEQ02224 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
CENPEQ02224 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
CENPEQ02224 LINC00871-202ENST00000556071 554 ntTSL 3 BASIC-1.4□□□□□ -2.63
CENPEQ02224 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
CENPEQ02224 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
CENPEQ02224 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC-1.4□□□□□ -2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms