Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TTPAP49638 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.55□□□□□ -2.32
TTPAP49638 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TTPAP49638 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TTPAP49638 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TTPAP49638 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TTPAP49638 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TTPAP49638 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TTPAP49638 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC0.54□□□□□ -2.32
TTPAP49638 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TTPAP49638 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TTPAP49638 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TTPAP49638 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TTPAP49638 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TTPAP49638 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TTPAP49638 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TTPAP49638 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TTPAP49638 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
TTPAP49638 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TTPAP49638 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TTPAP49638 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TTPAP49638 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
TTPAP49638 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TTPAP49638 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TTPAP49638 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
TTPAP49638 AC024933.1-201ENST00000608472 348 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TTPAP49638 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TTPAP49638 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TTPAP49638 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TTPAP49638 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TTPAP49638 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.53□□□□□ -2.32
TTPAP49638 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TTPAP49638 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TTPAP49638 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TTPAP49638 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC0.53□□□□□ -2.32
TTPAP49638 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TTPAP49638 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
TTPAP49638 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TTPAP49638 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TTPAP49638 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TTPAP49638 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TTPAP49638 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TTPAP49638 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TTPAP49638 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.52□□□□□ -2.33
TTPAP49638 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TTPAP49638 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TTPAP49638 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TTPAP49638 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TTPAP49638 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TTPAP49638 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TTPAP49638 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TTPAP49638 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
TTPAP49638 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TTPAP49638 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TTPAP49638 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TTPAP49638 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TTPAP49638 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
TTPAP49638 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TTPAP49638 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TTPAP49638 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC0.52□□□□□ -2.33
TTPAP49638 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TTPAP49638 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TTPAP49638 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TTPAP49638 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TTPAP49638 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TTPAP49638 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TTPAP49638 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TTPAP49638 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC0.51□□□□□ -2.33
TTPAP49638 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TTPAP49638 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TTPAP49638 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
TTPAP49638 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TTPAP49638 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TTPAP49638 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TTPAP49638 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TTPAP49638 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TTPAP49638 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TTPAP49638 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TTPAP49638 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TTPAP49638 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TTPAP49638 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TTPAP49638 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
TTPAP49638 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
TTPAP49638 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
TTPAP49638 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.51□□□□□ -2.33
TTPAP49638 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.5□□□□□ -2.33
TTPAP49638 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.5□□□□□ -2.33
TTPAP49638 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TTPAP49638 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TTPAP49638 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TTPAP49638 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TTPAP49638 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TTPAP49638 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TTPAP49638 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TTPAP49638 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TTPAP49638 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TTPAP49638 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TTPAP49638 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TTPAP49638 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TTPAP49638 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
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