Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC1.49□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC1.49□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC1.47□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
HOXD10P28358 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.45□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC1.45□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
HOXD10P28358 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
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