Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HOXC10Q9NYD6 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HOXC10Q9NYD6 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HOXC10Q9NYD6 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HOXC10Q9NYD6 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HOXC10Q9NYD6 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HOXC10Q9NYD6 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HOXC10Q9NYD6 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HOXC10Q9NYD6 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HOXC10Q9NYD6 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HOXC10Q9NYD6 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HOXC10Q9NYD6 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HOXC10Q9NYD6 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HOXC10Q9NYD6 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
HOXC10Q9NYD6 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
HOXC10Q9NYD6 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HOXC10Q9NYD6 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HOXC10Q9NYD6 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HOXC10Q9NYD6 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HOXC10Q9NYD6 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HOXC10Q9NYD6 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
HOXC10Q9NYD6 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HOXC10Q9NYD6 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
HOXC10Q9NYD6 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HOXC10Q9NYD6 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HOXC10Q9NYD6 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HOXC10Q9NYD6 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
HOXC10Q9NYD6 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
HOXC10Q9NYD6 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.25□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.25□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
HOXC10Q9NYD6 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.9 ms