Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
HOXD1Q9GZZ0 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC1.78□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HOXD1Q9GZZ0 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
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