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| DUX4L9 | Q6RFH8 | AC139792.2-201 | ENST00000624218 | 587 nt | BASIC | 1.15 | □□□□□ -2.23 | | |
| DUX4L9 | Q6RFH8 | AC008873.1-201 | ENST00000625051 | 138 nt | BASIC | 1.15 | □□□□□ -2.23 | | |
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| DUX4L9 | Q6RFH8 | AC068137.4-201 | ENST00000638485 | 296 nt | BASIC | 1.15 | □□□□□ -2.23 | | |
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| DUX4L9 | Q6RFH8 | AC100821.1-201 | ENST00000523153 | 2479 nt | BASIC | 1.14 | □□□□□ -2.23 | | |
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| DUX4L9 | Q6RFH8 | MTND5P35-201 | ENST00000557537 | 1720 nt | BASIC | 1.13 | □□□□□ -2.23 | | |
| DUX4L9 | Q6RFH8 | U8.1-201 | ENST00000362843 | 134 nt | BASIC | 1.13 | □□□□□ -2.23 | | |
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| DUX4L9 | Q6RFH8 | AC084816.1-207 | ENST00000538317 | 584 nt | TSL 4 BASIC | 1.13 | □□□□□ -2.23 | | |
| DUX4L9 | Q6RFH8 | AC008269.2-201 | ENST00000561915 | 1105 nt | BASIC | 1.13 | □□□□□ -2.23 | | |
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| DUX4L9 | Q6RFH8 | B3GNTL1P2-201 | ENST00000603673 | 288 nt | BASIC | 1.13 | □□□□□ -2.23 | | |
| DUX4L9 | Q6RFH8 | MIR8063-201 | ENST00000621930 | 81 nt | BASIC | 1.13 | □□□□□ -2.23 | | |
| DUX4L9 | Q6RFH8 | AC095038.3-201 | ENST00000634439 | 195 nt | BASIC | 1.13 | □□□□□ -2.23 | | |
| DUX4L9 | Q6RFH8 | MIR338-201 | ENST00000636369 | 67 nt | BASIC | 1.13 | □□□□□ -2.23 | | |
| DUX4L9 | Q6RFH8 | C9orf84-204 | ENST00000394777 | 4955 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 1.13 | □□□□□ -2.23 | | |
| DUX4L9 | Q6RFH8 | Y_RNA.191-201 | ENST00000363972 | 113 nt | BASIC | 1.12 | □□□□□ -2.23 | | |
| DUX4L9 | Q6RFH8 | Y_RNA.796-201 | ENST00000364268 | 102 nt | BASIC | 1.12 | □□□□□ -2.23 | | |
| DUX4L9 | Q6RFH8 | RNU6-534P-201 | ENST00000364877 | 106 nt | BASIC | 1.12 | □□□□□ -2.23 | | |
| DUX4L9 | Q6RFH8 | Y_RNA.799-201 | ENST00000364992 | 102 nt | BASIC | 1.12 | □□□□□ -2.23 | | |
| DUX4L9 | Q6RFH8 | SNORD116-11-201 | ENST00000383882 | 92 nt | BASIC | 1.12 | □□□□□ -2.23 | | |
| DUX4L9 | Q6RFH8 | RNU6-1013P-201 | ENST00000384180 | 107 nt | BASIC | 1.12 | □□□□□ -2.23 | | |
| DUX4L9 | Q6RFH8 | RNU6-541P-201 | ENST00000384709 | 110 nt | BASIC | 1.12 | □□□□□ -2.23 | | |
| DUX4L9 | Q6RFH8 | TRAJ41-201 | ENST00000390496 | 62 nt | APPRIS P1 BASIC | 1.12 | □□□□□ -2.23 | | |
| DUX4L9 | Q6RFH8 | MTND4LP16-201 | ENST00000440828 | 295 nt | BASIC | 1.12 | □□□□□ -2.23 | | |
| DUX4L9 | Q6RFH8 | MYCBP2-AS1-203 | ENST00000450627 | 349 nt | TSL 3 BASIC | 1.12 | □□□□□ -2.23 | | |
| DUX4L9 | Q6RFH8 | LINC01032-201 | ENST00000451690 | 276 nt | TSL 5 BASIC | 1.12 | □□□□□ -2.23 | | |
| DUX4L9 | Q6RFH8 | AC022445.1-201 | ENST00000457499 | 408 nt | TSL 3 BASIC | 1.12 | □□□□□ -2.23 | | |
| DUX4L9 | Q6RFH8 | RNU1-123P-201 | ENST00000458950 | 160 nt | BASIC | 1.12 | □□□□□ -2.23 | | |
| DUX4L9 | Q6RFH8 | snoU13.27-201 | ENST00000459278 | 104 nt | BASIC | 1.12 | □□□□□ -2.23 | | |
| DUX4L9 | Q6RFH8 | SRP72-202 | ENST00000504757 | 745 nt | TSL 2 BASIC | 1.12 | □□□□□ -2.23 | | |
| DUX4L9 | Q6RFH8 | AC026462.3-202 | ENST00000564361 | 515 nt | TSL 3 BASIC | 1.12 | □□□□□ -2.23 | | |
| DUX4L9 | Q6RFH8 | AC090517.2-201 | ENST00000614966 | 680 nt | BASIC | 1.12 | □□□□□ -2.23 | | |
| DUX4L9 | Q6RFH8 | U4.5-201 | ENST00000617137 | 123 nt | BASIC | 1.12 | □□□□□ -2.23 | | |
| DUX4L9 | Q6RFH8 | Six3os1_7.1-201 | ENST00000621512 | 201 nt | BASIC | 1.12 | □□□□□ -2.23 | | |
| DUX4L9 | Q6RFH8 | AC090617.10-201 | ENST00000624308 | 134 nt | BASIC | 1.12 | □□□□□ -2.23 | | |
| DUX4L9 | Q6RFH8 | snoZ196.1-201 | ENST00000625269 | 89 nt | BASIC | 1.12 | □□□□□ -2.23 | | |
| DUX4L9 | Q6RFH8 | ZNF404-202 | ENST00000587539 | 1851 nt | APPRIS P2 TSL 5 BASIC | 1.12 | □□□□□ -2.23 | | |
| DUX4L9 | Q6RFH8 | NPAT-201 | ENST00000278612 | 6117 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 1.11 | □□□□□ -2.23 | | |
| DUX4L9 | Q6RFH8 | CEP162-202 | ENST00000403245 | 5156 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 1.11 | □□□□□ -2.23 | | |
| DUX4L9 | Q6RFH8 | Y_RNA.89-201 | ENST00000363031 | 102 nt | BASIC | 1.11 | □□□□□ -2.23 | | |
| DUX4L9 | Q6RFH8 | RNU6-392P-201 | ENST00000364926 | 101 nt | BASIC | 1.11 | □□□□□ -2.23 | | |
| DUX4L9 | Q6RFH8 | RNU6-203P-201 | ENST00000384038 | 104 nt | BASIC | 1.11 | □□□□□ -2.23 | | |
| DUX4L9 | Q6RFH8 | MIR150-201 | ENST00000385048 | 84 nt | BASIC | 1.11 | □□□□□ -2.23 | | |
| DUX4L9 | Q6RFH8 | RNA5SP323-201 | ENST00000391094 | 133 nt | BASIC | 1.11 | □□□□□ -2.23 | | |
| DUX4L9 | Q6RFH8 | SNORD115-47-201 | ENST00000391226 | 86 nt | BASIC | 1.11 | □□□□□ -2.23 | | |
| DUX4L9 | Q6RFH8 | SNAP23-203 | ENST00000397138 | 477 nt | TSL 1 (best) BASIC | 1.11 | □□□□□ -2.23 | | |
| DUX4L9 | Q6RFH8 | MIR1276-201 | ENST00000408707 | 83 nt | BASIC | 1.11 | □□□□□ -2.23 | | |