Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC0.93□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC0.93□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.93□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
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ZBED9Q6R2W3 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
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ZBED9Q6R2W3 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
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ZBED9Q6R2W3 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
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ZBED9Q6R2W3 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
ZBED9Q6R2W3 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.9□□□□□ -2.26
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