Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC1.72□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.71□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC1.71□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC1.71□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.7□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
KNOP1Q1ED39 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
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