Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPROQ16827 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPROQ16827 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPROQ16827 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPROQ16827 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPROQ16827 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPROQ16827 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPROQ16827 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPROQ16827 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPROQ16827 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPROQ16827 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPROQ16827 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPROQ16827 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPROQ16827 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPROQ16827 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PTPROQ16827 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPROQ16827 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPROQ16827 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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PTPROQ16827 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPROQ16827 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPROQ16827 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPROQ16827 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPROQ16827 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPROQ16827 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPROQ16827 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPROQ16827 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPROQ16827 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPROQ16827 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPROQ16827 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPROQ16827 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPROQ16827 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPROQ16827 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPROQ16827 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPROQ16827 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPROQ16827 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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PTPROQ16827 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPROQ16827 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPROQ16827 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPROQ16827 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPROQ16827 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPROQ16827 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPROQ16827 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPROQ16827 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPROQ16827 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPROQ16827 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPROQ16827 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
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PTPROQ16827 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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PTPROQ16827 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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PTPROQ16827 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPROQ16827 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
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PTPROQ16827 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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PTPROQ16827 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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PTPROQ16827 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPROQ16827 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPROQ16827 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPROQ16827 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
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PTPROQ16827 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPROQ16827 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPROQ16827 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPROQ16827 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPROQ16827 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPROQ16827 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPROQ16827 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPROQ16827 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
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PTPROQ16827 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPROQ16827 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPROQ16827 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPROQ16827 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPROQ16827 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPROQ16827 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPROQ16827 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPROQ16827 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPROQ16827 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPROQ16827 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPROQ16827 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPROQ16827 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPROQ16827 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
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