Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
NRF1Q16656 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NRF1Q16656 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
NRF1Q16656 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NRF1Q16656 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NRF1Q16656 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
NRF1Q16656 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NRF1Q16656 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NRF1Q16656 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NRF1Q16656 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NRF1Q16656 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NRF1Q16656 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
NRF1Q16656 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
NRF1Q16656 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NRF1Q16656 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NRF1Q16656 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NRF1Q16656 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NRF1Q16656 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NRF1Q16656 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
NRF1Q16656 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
NRF1Q16656 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NRF1Q16656 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NRF1Q16656 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NRF1Q16656 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NRF1Q16656 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NRF1Q16656 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NRF1Q16656 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NRF1Q16656 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
NRF1Q16656 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NRF1Q16656 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
NRF1Q16656 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NRF1Q16656 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NRF1Q16656 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
NRF1Q16656 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NRF1Q16656 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NRF1Q16656 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NRF1Q16656 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NRF1Q16656 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NRF1Q16656 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NRF1Q16656 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NRF1Q16656 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
NRF1Q16656 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NRF1Q16656 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NRF1Q16656 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NRF1Q16656 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NRF1Q16656 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NRF1Q16656 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
NRF1Q16656 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
NRF1Q16656 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
NRF1Q16656 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
NRF1Q16656 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NRF1Q16656 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NRF1Q16656 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NRF1Q16656 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NRF1Q16656 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NRF1Q16656 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NRF1Q16656 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NRF1Q16656 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NRF1Q16656 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NRF1Q16656 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NRF1Q16656 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NRF1Q16656 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NRF1Q16656 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NRF1Q16656 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NRF1Q16656 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NRF1Q16656 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NRF1Q16656 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NRF1Q16656 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NRF1Q16656 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NRF1Q16656 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NRF1Q16656 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NRF1Q16656 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NRF1Q16656 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NRF1Q16656 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NRF1Q16656 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NRF1Q16656 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NRF1Q16656 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NRF1Q16656 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NRF1Q16656 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NRF1Q16656 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NRF1Q16656 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NRF1Q16656 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NRF1Q16656 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NRF1Q16656 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
NRF1Q16656 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NRF1Q16656 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NRF1Q16656 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NRF1Q16656 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NRF1Q16656 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NRF1Q16656 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NRF1Q16656 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
NRF1Q16656 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
NRF1Q16656 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NRF1Q16656 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NRF1Q16656 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
NRF1Q16656 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NRF1Q16656 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NRF1Q16656 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NRF1Q16656 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NRF1Q16656 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.3 ms