Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
SNAPC1Q16533 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SNAPC1Q16533 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SNAPC1Q16533 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SNAPC1Q16533 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SNAPC1Q16533 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SNAPC1Q16533 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SNAPC1Q16533 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SNAPC1Q16533 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SNAPC1Q16533 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SNAPC1Q16533 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
SNAPC1Q16533 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SNAPC1Q16533 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SNAPC1Q16533 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SNAPC1Q16533 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SNAPC1Q16533 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SNAPC1Q16533 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
SNAPC1Q16533 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
SNAPC1Q16533 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
SNAPC1Q16533 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SNAPC1Q16533 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
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