Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.49
ZFHX3Q15911 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.49
ZFHX3Q15911 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.49
ZFHX3Q15911 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.49
ZFHX3Q15911 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.49
ZFHX3Q15911 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.49
ZFHX3Q15911 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.49
ZFHX3Q15911 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.49
ZFHX3Q15911 SNORD114-11-201ENST00000363738 75 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ZFHX3Q15911 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ZFHX3Q15911 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ZFHX3Q15911 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ZFHX3Q15911 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
ZFHX3Q15911 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ZFHX3Q15911 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ZFHX3Q15911 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ZFHX3Q15911 hsa-mir-550a-2.1-201ENST00000637473 97 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ZFHX3Q15911 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ZFHX3Q15911 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ZFHX3Q15911 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ZFHX3Q15911 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ZFHX3Q15911 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ZFHX3Q15911 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ZFHX3Q15911 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ZFHX3Q15911 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ZFHX3Q15911 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ZFHX3Q15911 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ZFHX3Q15911 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ZFHX3Q15911 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
ZFHX3Q15911 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ZFHX3Q15911 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ZFHX3Q15911 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ZFHX3Q15911 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ZFHX3Q15911 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
ZFHX3Q15911 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ZFHX3Q15911 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
ZFHX3Q15911 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ZFHX3Q15911 MIR196A1-201ENST00000388006 70 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ZFHX3Q15911 RNU6-796P-201ENST00000391086 107 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ZFHX3Q15911 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ZFHX3Q15911 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ZFHX3Q15911 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ZFHX3Q15911 MIR496-201ENST00000385226 102 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ZFHX3Q15911 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ZFHX3Q15911 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ZFHX3Q15911 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ZFHX3Q15911 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ZFHX3Q15911 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ZFHX3Q15911 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
ZFHX3Q15911 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ZFHX3Q15911 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ZFHX3Q15911 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
ZFHX3Q15911 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ZFHX3Q15911 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ZFHX3Q15911 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ZFHX3Q15911 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ZFHX3Q15911 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ZFHX3Q15911 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ZFHX3Q15911 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ZFHX3Q15911 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ZFHX3Q15911 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
ZFHX3Q15911 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ZFHX3Q15911 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
ZFHX3Q15911 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ZFHX3Q15911 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ZFHX3Q15911 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ZFHX3Q15911 AC099654.8-201ENST00000637757 681 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ZFHX3Q15911 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ZFHX3Q15911 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ZFHX3Q15911 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ZFHX3Q15911 RNU6-1247P-201ENST00000516622 98 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ZFHX3Q15911 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ZFHX3Q15911 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
ZFHX3Q15911 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ZFHX3Q15911 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ZFHX3Q15911 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC-0.51□□□□□ -2.49
ZFHX3Q15911 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
ZFHX3Q15911 RNY4-201ENST00000516507 96 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ZFHX3Q15911 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ZFHX3Q15911 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ZFHX3Q15911 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ZFHX3Q15911 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ZFHX3Q15911 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ZFHX3Q15911 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ZFHX3Q15911 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ZFHX3Q15911 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ZFHX3Q15911 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ZFHX3Q15911 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
ZFHX3Q15911 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ZFHX3Q15911 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ZFHX3Q15911 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ZFHX3Q15911 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ZFHX3Q15911 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ZFHX3Q15911 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ZFHX3Q15911 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ZFHX3Q15911 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
ZFHX3Q15911 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ZFHX3Q15911 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ZFHX3Q15911 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
ZFHX3Q15911 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 363.4 ms