Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
USF2Q15853 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
USF2Q15853 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
USF2Q15853 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
USF2Q15853 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
USF2Q15853 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
USF2Q15853 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
USF2Q15853 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
USF2Q15853 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
USF2Q15853 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
USF2Q15853 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC0.42□□□□□ -2.34
USF2Q15853 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
USF2Q15853 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
USF2Q15853 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
USF2Q15853 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
USF2Q15853 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
USF2Q15853 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
USF2Q15853 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
USF2Q15853 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
USF2Q15853 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
USF2Q15853 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
USF2Q15853 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
USF2Q15853 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
USF2Q15853 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
USF2Q15853 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
USF2Q15853 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
USF2Q15853 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
USF2Q15853 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
USF2Q15853 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
USF2Q15853 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC0.41□□□□□ -2.34
USF2Q15853 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
USF2Q15853 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
USF2Q15853 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
USF2Q15853 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
USF2Q15853 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
USF2Q15853 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
USF2Q15853 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
USF2Q15853 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
USF2Q15853 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
USF2Q15853 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
USF2Q15853 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
USF2Q15853 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
USF2Q15853 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
USF2Q15853 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
USF2Q15853 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
USF2Q15853 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
USF2Q15853 AC011458.1-201ENST00000604034 617 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
USF2Q15853 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
USF2Q15853 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
USF2Q15853 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
USF2Q15853 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
USF2Q15853 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
USF2Q15853 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
USF2Q15853 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
USF2Q15853 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
USF2Q15853 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.4□□□□□ -2.35
USF2Q15853 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
USF2Q15853 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
USF2Q15853 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
USF2Q15853 AC091917.1-201ENST00000506330 566 ntTSL 4 BASIC0.4□□□□□ -2.35
USF2Q15853 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
USF2Q15853 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.35
USF2Q15853 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC0.4□□□□□ -2.35
USF2Q15853 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
USF2Q15853 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
USF2Q15853 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
USF2Q15853 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.4□□□□□ -2.35
USF2Q15853 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
USF2Q15853 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.39□□□□□ -2.35
USF2Q15853 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
USF2Q15853 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
USF2Q15853 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
USF2Q15853 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
USF2Q15853 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
USF2Q15853 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
USF2Q15853 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
USF2Q15853 MTND2P39-201ENST00000457230 764 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
USF2Q15853 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
USF2Q15853 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC0.39□□□□□ -2.35
USF2Q15853 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
USF2Q15853 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
USF2Q15853 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
USF2Q15853 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
USF2Q15853 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
USF2Q15853 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
USF2Q15853 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
USF2Q15853 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
USF2Q15853 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
USF2Q15853 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
USF2Q15853 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
USF2Q15853 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
USF2Q15853 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
USF2Q15853 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
USF2Q15853 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
USF2Q15853 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
USF2Q15853 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
USF2Q15853 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
USF2Q15853 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
USF2Q15853 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
USF2Q15853 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
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