Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CYTH1Q15438 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CYTH1Q15438 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CYTH1Q15438 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CYTH1Q15438 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CYTH1Q15438 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CYTH1Q15438 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
CYTH1Q15438 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CYTH1Q15438 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CYTH1Q15438 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CYTH1Q15438 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CYTH1Q15438 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CYTH1Q15438 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CYTH1Q15438 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
CYTH1Q15438 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CYTH1Q15438 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CYTH1Q15438 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CYTH1Q15438 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CYTH1Q15438 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CYTH1Q15438 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
CYTH1Q15438 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
CYTH1Q15438 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CYTH1Q15438 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CYTH1Q15438 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CYTH1Q15438 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CYTH1Q15438 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
CYTH1Q15438 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CYTH1Q15438 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CYTH1Q15438 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CYTH1Q15438 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CYTH1Q15438 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CYTH1Q15438 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CYTH1Q15438 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
CYTH1Q15438 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CYTH1Q15438 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CYTH1Q15438 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CYTH1Q15438 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CYTH1Q15438 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CYTH1Q15438 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CYTH1Q15438 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
CYTH1Q15438 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CYTH1Q15438 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CYTH1Q15438 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CYTH1Q15438 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
CYTH1Q15438 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CYTH1Q15438 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CYTH1Q15438 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CYTH1Q15438 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CYTH1Q15438 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CYTH1Q15438 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
CYTH1Q15438 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CYTH1Q15438 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
CYTH1Q15438 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CYTH1Q15438 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CYTH1Q15438 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
CYTH1Q15438 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CYTH1Q15438 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CYTH1Q15438 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CYTH1Q15438 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CYTH1Q15438 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CYTH1Q15438 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CYTH1Q15438 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
CYTH1Q15438 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
CYTH1Q15438 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CYTH1Q15438 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
CYTH1Q15438 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CYTH1Q15438 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CYTH1Q15438 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CYTH1Q15438 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CYTH1Q15438 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CYTH1Q15438 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
CYTH1Q15438 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CYTH1Q15438 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CYTH1Q15438 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CYTH1Q15438 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CYTH1Q15438 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CYTH1Q15438 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CYTH1Q15438 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CYTH1Q15438 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CYTH1Q15438 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CYTH1Q15438 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CYTH1Q15438 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CYTH1Q15438 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CYTH1Q15438 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CYTH1Q15438 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
CYTH1Q15438 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CYTH1Q15438 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CYTH1Q15438 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CYTH1Q15438 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CYTH1Q15438 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
CYTH1Q15438 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CYTH1Q15438 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
CYTH1Q15438 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CYTH1Q15438 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CYTH1Q15438 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CYTH1Q15438 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CYTH1Q15438 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CYTH1Q15438 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CYTH1Q15438 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CYTH1Q15438 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.3 ms