Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SYCP1Q15431 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SYCP1Q15431 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SYCP1Q15431 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SYCP1Q15431 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SYCP1Q15431 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC0.48□□□□□ -2.33
SYCP1Q15431 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SYCP1Q15431 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SYCP1Q15431 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC0.48□□□□□ -2.33
SYCP1Q15431 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SYCP1Q15431 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
SYCP1Q15431 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SYCP1Q15431 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SYCP1Q15431 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SYCP1Q15431 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
SYCP1Q15431 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
SYCP1Q15431 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SYCP1Q15431 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SYCP1Q15431 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SYCP1Q15431 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SYCP1Q15431 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SYCP1Q15431 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
SYCP1Q15431 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SYCP1Q15431 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SYCP1Q15431 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SYCP1Q15431 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SYCP1Q15431 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SYCP1Q15431 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SYCP1Q15431 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SYCP1Q15431 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SYCP1Q15431 AL391834.2-201ENST00000609982 546 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SYCP1Q15431 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SYCP1Q15431 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SYCP1Q15431 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SYCP1Q15431 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SYCP1Q15431 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SYCP1Q15431 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SYCP1Q15431 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SYCP1Q15431 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SYCP1Q15431 MTND2P14-201ENST00000482139 351 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SYCP1Q15431 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SYCP1Q15431 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SYCP1Q15431 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SYCP1Q15431 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
SYCP1Q15431 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SYCP1Q15431 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SYCP1Q15431 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.45□□□□□ -2.34
SYCP1Q15431 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SYCP1Q15431 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SYCP1Q15431 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SYCP1Q15431 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC0.45□□□□□ -2.34
SYCP1Q15431 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SYCP1Q15431 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
SYCP1Q15431 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
SYCP1Q15431 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC0.45□□□□□ -2.34
SYCP1Q15431 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
SYCP1Q15431 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SYCP1Q15431 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SYCP1Q15431 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SYCP1Q15431 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SYCP1Q15431 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SYCP1Q15431 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SYCP1Q15431 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SYCP1Q15431 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.44□□□□□ -2.34
SYCP1Q15431 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SYCP1Q15431 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SYCP1Q15431 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SYCP1Q15431 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SYCP1Q15431 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC0.44□□□□□ -2.34
SYCP1Q15431 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
SYCP1Q15431 AL354692.1-201ENST00000423044 315 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SYCP1Q15431 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
SYCP1Q15431 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SYCP1Q15431 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SYCP1Q15431 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SYCP1Q15431 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SYCP1Q15431 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SYCP1Q15431 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SYCP1Q15431 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
SYCP1Q15431 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SYCP1Q15431 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SYCP1Q15431 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SYCP1Q15431 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SYCP1Q15431 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SYCP1Q15431 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SYCP1Q15431 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SYCP1Q15431 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SYCP1Q15431 AL390783.1-203ENST00000457058 248 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
SYCP1Q15431 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SYCP1Q15431 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC0.43□□□□□ -2.34
SYCP1Q15431 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SYCP1Q15431 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SYCP1Q15431 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SYCP1Q15431 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
SYCP1Q15431 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SYCP1Q15431 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SYCP1Q15431 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SYCP1Q15431 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SYCP1Q15431 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SYCP1Q15431 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.5 ms