Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
APOFQ13790 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
APOFQ13790 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
APOFQ13790 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
APOFQ13790 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC0.62□□□□□ -2.31
APOFQ13790 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
APOFQ13790 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
APOFQ13790 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
APOFQ13790 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
APOFQ13790 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
APOFQ13790 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
APOFQ13790 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
APOFQ13790 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
APOFQ13790 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
APOFQ13790 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
APOFQ13790 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
APOFQ13790 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
APOFQ13790 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
APOFQ13790 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
APOFQ13790 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
APOFQ13790 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC0.61□□□□□ -2.31
APOFQ13790 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
APOFQ13790 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
APOFQ13790 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
APOFQ13790 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
APOFQ13790 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
APOFQ13790 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
APOFQ13790 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
APOFQ13790 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
APOFQ13790 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
APOFQ13790 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
APOFQ13790 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
APOFQ13790 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
APOFQ13790 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
APOFQ13790 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
APOFQ13790 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.6□□□□□ -2.31
APOFQ13790 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
APOFQ13790 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
APOFQ13790 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
APOFQ13790 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
APOFQ13790 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
APOFQ13790 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
APOFQ13790 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
APOFQ13790 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
APOFQ13790 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
APOFQ13790 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
APOFQ13790 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
APOFQ13790 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
APOFQ13790 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
APOFQ13790 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
APOFQ13790 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
APOFQ13790 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
APOFQ13790 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
APOFQ13790 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
APOFQ13790 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
APOFQ13790 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
APOFQ13790 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
APOFQ13790 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
APOFQ13790 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
APOFQ13790 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
APOFQ13790 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
APOFQ13790 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
APOFQ13790 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
APOFQ13790 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
APOFQ13790 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
APOFQ13790 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
APOFQ13790 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
APOFQ13790 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC0.59□□□□□ -2.31
APOFQ13790 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
APOFQ13790 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
APOFQ13790 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
APOFQ13790 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
APOFQ13790 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
APOFQ13790 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
APOFQ13790 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
APOFQ13790 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.31
APOFQ13790 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
APOFQ13790 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
APOFQ13790 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
APOFQ13790 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
APOFQ13790 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
APOFQ13790 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
APOFQ13790 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
APOFQ13790 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
APOFQ13790 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
APOFQ13790 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
APOFQ13790 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
APOFQ13790 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
APOFQ13790 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
APOFQ13790 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
APOFQ13790 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
APOFQ13790 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
APOFQ13790 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
APOFQ13790 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
APOFQ13790 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
APOFQ13790 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
APOFQ13790 AC073641.1-201ENST00000425192 429 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
APOFQ13790 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
APOFQ13790 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
APOFQ13790 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.8 ms