Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC0.64□□□□□ -2.31
HTR4Q13639 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HTR4Q13639 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HTR4Q13639 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HTR4Q13639 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.64□□□□□ -2.31
HTR4Q13639 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HTR4Q13639 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC0.64□□□□□ -2.31
HTR4Q13639 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HTR4Q13639 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HTR4Q13639 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HTR4Q13639 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HTR4Q13639 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HTR4Q13639 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HTR4Q13639 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HTR4Q13639 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
HTR4Q13639 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
HTR4Q13639 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HTR4Q13639 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
HTR4Q13639 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HTR4Q13639 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
HTR4Q13639 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HTR4Q13639 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HTR4Q13639 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
HTR4Q13639 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HTR4Q13639 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HTR4Q13639 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HTR4Q13639 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HTR4Q13639 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HTR4Q13639 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HTR4Q13639 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HTR4Q13639 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HTR4Q13639 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HTR4Q13639 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HTR4Q13639 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
HTR4Q13639 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
HTR4Q13639 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HTR4Q13639 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HTR4Q13639 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HTR4Q13639 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HTR4Q13639 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HTR4Q13639 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HTR4Q13639 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
HTR4Q13639 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
HTR4Q13639 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HTR4Q13639 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HTR4Q13639 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HTR4Q13639 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HTR4Q13639 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HTR4Q13639 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HTR4Q13639 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HTR4Q13639 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
HTR4Q13639 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HTR4Q13639 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HTR4Q13639 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HTR4Q13639 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HTR4Q13639 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HTR4Q13639 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HTR4Q13639 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC0.62□□□□□ -2.31
HTR4Q13639 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HTR4Q13639 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HTR4Q13639 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HTR4Q13639 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HTR4Q13639 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
HTR4Q13639 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HTR4Q13639 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HTR4Q13639 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HTR4Q13639 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HTR4Q13639 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HTR4Q13639 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HTR4Q13639 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC0.61□□□□□ -2.31
HTR4Q13639 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HTR4Q13639 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HTR4Q13639 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HTR4Q13639 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HTR4Q13639 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HTR4Q13639 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HTR4Q13639 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HTR4Q13639 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HTR4Q13639 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.61□□□□□ -2.31
HTR4Q13639 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HTR4Q13639 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HTR4Q13639 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HTR4Q13639 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
HTR4Q13639 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HTR4Q13639 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HTR4Q13639 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HTR4Q13639 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HTR4Q13639 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HTR4Q13639 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
HTR4Q13639 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC0.61□□□□□ -2.31
HTR4Q13639 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HTR4Q13639 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC0.61□□□□□ -2.31
HTR4Q13639 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HTR4Q13639 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HTR4Q13639 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HTR4Q13639 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HTR4Q13639 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HTR4Q13639 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HTR4Q13639 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HTR4Q13639 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.9 ms