Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTCH1Q13635 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTCH1Q13635 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTCH1Q13635 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTCH1Q13635 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTCH1Q13635 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
PTCH1Q13635 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTCH1Q13635 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTCH1Q13635 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTCH1Q13635 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTCH1Q13635 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
PTCH1Q13635 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTCH1Q13635 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTCH1Q13635 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
PTCH1Q13635 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTCH1Q13635 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTCH1Q13635 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTCH1Q13635 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTCH1Q13635 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTCH1Q13635 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.57□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTCH1Q13635 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
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