Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CUL3Q13618 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC1.77□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CUL3Q13618 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.4 ms