Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC0.01□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC0.01□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 BNIP3P39-201ENST00000601077 554 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC0□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC0□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC0□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC0□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC0□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC0□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC0□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC0□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC0□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 GYG2-AS1-201ENST00000445107 515 ntTSL 5 BASIC0□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC0□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC0□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC0□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC0□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC0□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC0□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC0□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC0□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC0□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC0□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC-0.01□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
KRR1Q13601 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.03□□□□□ -2.42
KRR1Q13601 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
KRR1Q13601 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
KRR1Q13601 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
KRR1Q13601 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
KRR1Q13601 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
KRR1Q13601 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
KRR1Q13601 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.2 ms