Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
C1orf61Q13536 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
C1orf61Q13536 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
C1orf61Q13536 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
C1orf61Q13536 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
C1orf61Q13536 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
C1orf61Q13536 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
C1orf61Q13536 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
C1orf61Q13536 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
C1orf61Q13536 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
C1orf61Q13536 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
C1orf61Q13536 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
C1orf61Q13536 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
C1orf61Q13536 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
C1orf61Q13536 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
C1orf61Q13536 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
C1orf61Q13536 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
C1orf61Q13536 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
C1orf61Q13536 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
C1orf61Q13536 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
C1orf61Q13536 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
C1orf61Q13536 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
C1orf61Q13536 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
C1orf61Q13536 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
C1orf61Q13536 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
C1orf61Q13536 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
C1orf61Q13536 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
C1orf61Q13536 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
C1orf61Q13536 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
C1orf61Q13536 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC1.2□□□□□ -2.22
C1orf61Q13536 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
C1orf61Q13536 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC1.2□□□□□ -2.22
C1orf61Q13536 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
C1orf61Q13536 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
C1orf61Q13536 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
C1orf61Q13536 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
C1orf61Q13536 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
C1orf61Q13536 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
C1orf61Q13536 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
C1orf61Q13536 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
C1orf61Q13536 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
C1orf61Q13536 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
C1orf61Q13536 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
C1orf61Q13536 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
C1orf61Q13536 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
C1orf61Q13536 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
C1orf61Q13536 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
C1orf61Q13536 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
C1orf61Q13536 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
C1orf61Q13536 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
C1orf61Q13536 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
C1orf61Q13536 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
C1orf61Q13536 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
C1orf61Q13536 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
C1orf61Q13536 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
C1orf61Q13536 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
C1orf61Q13536 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
C1orf61Q13536 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
C1orf61Q13536 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
C1orf61Q13536 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
C1orf61Q13536 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
C1orf61Q13536 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
C1orf61Q13536 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
C1orf61Q13536 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
C1orf61Q13536 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
C1orf61Q13536 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
C1orf61Q13536 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
C1orf61Q13536 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
C1orf61Q13536 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
C1orf61Q13536 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
C1orf61Q13536 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
C1orf61Q13536 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
C1orf61Q13536 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
C1orf61Q13536 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
C1orf61Q13536 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
C1orf61Q13536 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
C1orf61Q13536 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
C1orf61Q13536 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
C1orf61Q13536 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
C1orf61Q13536 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
C1orf61Q13536 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
C1orf61Q13536 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
C1orf61Q13536 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
C1orf61Q13536 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
C1orf61Q13536 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
C1orf61Q13536 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
C1orf61Q13536 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
C1orf61Q13536 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
C1orf61Q13536 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
C1orf61Q13536 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
C1orf61Q13536 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
C1orf61Q13536 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
C1orf61Q13536 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
C1orf61Q13536 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
C1orf61Q13536 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
C1orf61Q13536 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
C1orf61Q13536 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
C1orf61Q13536 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
C1orf61Q13536 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
C1orf61Q13536 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.1 ms