Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TOP3AQ13472 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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