Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
TCOF1Q13428 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.11□□□□□ -2.43
TCOF1Q13428 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
TCOF1Q13428 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
TCOF1Q13428 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
TCOF1Q13428 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
TCOF1Q13428 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
TCOF1Q13428 AC091917.1-201ENST00000506330 566 ntTSL 4 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
TCOF1Q13428 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
TCOF1Q13428 MTATP6P9-201ENST00000515039 680 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
TCOF1Q13428 MTATP6P15-201ENST00000527233 835 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
TCOF1Q13428 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
TCOF1Q13428 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
TCOF1Q13428 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
TCOF1Q13428 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
TCOF1Q13428 RNU6-1192P-201ENST00000612197 107 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
TCOF1Q13428 AL512506.1-201ENST00000613918 449 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
TCOF1Q13428 RNU6-489P-201ENST00000618289 107 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
TCOF1Q13428 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
TCOF1Q13428 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
TCOF1Q13428 AC091948.2-201ENST00000636510 279 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
TCOF1Q13428 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TCOF1Q13428 Y_RNA.457-201ENST00000384237 111 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TCOF1Q13428 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TCOF1Q13428 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TCOF1Q13428 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TCOF1Q13428 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TCOF1Q13428 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TCOF1Q13428 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
TCOF1Q13428 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TCOF1Q13428 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
TCOF1Q13428 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
TCOF1Q13428 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TCOF1Q13428 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TCOF1Q13428 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TCOF1Q13428 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TCOF1Q13428 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TCOF1Q13428 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC-0.12□□□□□ -2.43
TCOF1Q13428 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
TCOF1Q13428 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TCOF1Q13428 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
TCOF1Q13428 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
TCOF1Q13428 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
TCOF1Q13428 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
TCOF1Q13428 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
TCOF1Q13428 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
TCOF1Q13428 ZNF736P1Y-201ENST00000440402 1276 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
TCOF1Q13428 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
TCOF1Q13428 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
TCOF1Q13428 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
TCOF1Q13428 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
TCOF1Q13428 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
TCOF1Q13428 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
TCOF1Q13428 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
TCOF1Q13428 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
TCOF1Q13428 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
TCOF1Q13428 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
TCOF1Q13428 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
TCOF1Q13428 AL358176.1-201ENST00000457477 357 ntTSL 5 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
TCOF1Q13428 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
TCOF1Q13428 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
TCOF1Q13428 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
TCOF1Q13428 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
TCOF1Q13428 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
TCOF1Q13428 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
TCOF1Q13428 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
TCOF1Q13428 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
TCOF1Q13428 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
TCOF1Q13428 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
TCOF1Q13428 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
TCOF1Q13428 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
TCOF1Q13428 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
TCOF1Q13428 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
TCOF1Q13428 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
TCOF1Q13428 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
TCOF1Q13428 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
TCOF1Q13428 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
TCOF1Q13428 AL121895.2-201ENST00000619558 447 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
TCOF1Q13428 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
TCOF1Q13428 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
TCOF1Q13428 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
TCOF1Q13428 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC-0.16□□□□□ -2.43
TCOF1Q13428 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC-0.16□□□□□ -2.43
TCOF1Q13428 GYG2-AS1-201ENST00000445107 515 ntTSL 5 BASIC-0.16□□□□□ -2.43
TCOF1Q13428 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
TCOF1Q13428 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC-0.16□□□□□ -2.43
TCOF1Q13428 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
TCOF1Q13428 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
TCOF1Q13428 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
TCOF1Q13428 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
TCOF1Q13428 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
TCOF1Q13428 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
TCOF1Q13428 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
TCOF1Q13428 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
TCOF1Q13428 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
TCOF1Q13428 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
TCOF1Q13428 BTBD7P2-201ENST00000441962 620 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
TCOF1Q13428 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
TCOF1Q13428 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
TCOF1Q13428 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.2 ms