Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ITGB3BPQ13352 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC0.02□□□□□ -2.41
ITGB3BPQ13352 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ITGB3BPQ13352 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ITGB3BPQ13352 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC0.02□□□□□ -2.41
ITGB3BPQ13352 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ITGB3BPQ13352 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ITGB3BPQ13352 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ITGB3BPQ13352 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ITGB3BPQ13352 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC0.02□□□□□ -2.41
ITGB3BPQ13352 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ITGB3BPQ13352 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ITGB3BPQ13352 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ITGB3BPQ13352 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ITGB3BPQ13352 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ITGB3BPQ13352 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC0.01□□□□□ -2.41
ITGB3BPQ13352 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC0.01□□□□□ -2.41
ITGB3BPQ13352 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ITGB3BPQ13352 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ITGB3BPQ13352 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ITGB3BPQ13352 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ITGB3BPQ13352 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ITGB3BPQ13352 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ITGB3BPQ13352 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ITGB3BPQ13352 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ITGB3BPQ13352 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ITGB3BPQ13352 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC0□□□□□ -2.41
ITGB3BPQ13352 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ITGB3BPQ13352 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ITGB3BPQ13352 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ITGB3BPQ13352 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ITGB3BPQ13352 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ITGB3BPQ13352 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ITGB3BPQ13352 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ITGB3BPQ13352 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ITGB3BPQ13352 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ITGB3BPQ13352 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ITGB3BPQ13352 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
ITGB3BPQ13352 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
ITGB3BPQ13352 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ITGB3BPQ13352 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ITGB3BPQ13352 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ITGB3BPQ13352 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ITGB3BPQ13352 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ITGB3BPQ13352 AL355143.1-201ENST00000407101 841 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ITGB3BPQ13352 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
ITGB3BPQ13352 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
ITGB3BPQ13352 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
ITGB3BPQ13352 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ITGB3BPQ13352 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
ITGB3BPQ13352 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
ITGB3BPQ13352 MTND2P31-201ENST00000512602 616 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ITGB3BPQ13352 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ITGB3BPQ13352 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ITGB3BPQ13352 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ITGB3BPQ13352 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ITGB3BPQ13352 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ITGB3BPQ13352 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
ITGB3BPQ13352 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ITGB3BPQ13352 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.03□□□□□ -2.41
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ITGB3BPQ13352 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ITGB3BPQ13352 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ITGB3BPQ13352 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
ITGB3BPQ13352 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
ITGB3BPQ13352 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ITGB3BPQ13352 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ITGB3BPQ13352 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ITGB3BPQ13352 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
ITGB3BPQ13352 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ITGB3BPQ13352 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ITGB3BPQ13352 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ITGB3BPQ13352 AC069431.2-201ENST00000604149 1099 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ITGB3BPQ13352 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ITGB3BPQ13352 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
ITGB3BPQ13352 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ITGB3BPQ13352 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ITGB3BPQ13352 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ITGB3BPQ13352 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ITGB3BPQ13352 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ITGB3BPQ13352 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ITGB3BPQ13352 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ITGB3BPQ13352 BNIP3P39-201ENST00000601077 554 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ITGB3BPQ13352 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ITGB3BPQ13352 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ITGB3BPQ13352 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ITGB3BPQ13352 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ITGB3BPQ13352 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ITGB3BPQ13352 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ITGB3BPQ13352 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ITGB3BPQ13352 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ITGB3BPQ13352 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ITGB3BPQ13352 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ITGB3BPQ13352 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ITGB3BPQ13352 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
ITGB3BPQ13352 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
ITGB3BPQ13352 USP9YP25-201ENST00000457708 443 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.3 ms