Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
KLF1Q13351 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
KLF1Q13351 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
KLF1Q13351 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
KLF1Q13351 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
KLF1Q13351 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
KLF1Q13351 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KLF1Q13351 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
KLF1Q13351 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
KLF1Q13351 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KLF1Q13351 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KLF1Q13351 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KLF1Q13351 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
KLF1Q13351 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KLF1Q13351 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KLF1Q13351 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KLF1Q13351 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KLF1Q13351 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KLF1Q13351 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KLF1Q13351 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KLF1Q13351 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KLF1Q13351 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KLF1Q13351 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KLF1Q13351 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KLF1Q13351 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KLF1Q13351 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KLF1Q13351 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KLF1Q13351 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KLF1Q13351 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KLF1Q13351 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KLF1Q13351 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KLF1Q13351 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KLF1Q13351 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KLF1Q13351 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KLF1Q13351 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KLF1Q13351 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KLF1Q13351 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KLF1Q13351 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KLF1Q13351 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KLF1Q13351 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KLF1Q13351 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KLF1Q13351 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KLF1Q13351 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KLF1Q13351 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KLF1Q13351 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KLF1Q13351 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KLF1Q13351 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KLF1Q13351 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KLF1Q13351 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KLF1Q13351 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KLF1Q13351 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KLF1Q13351 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KLF1Q13351 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KLF1Q13351 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KLF1Q13351 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KLF1Q13351 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KLF1Q13351 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KLF1Q13351 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KLF1Q13351 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KLF1Q13351 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KLF1Q13351 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KLF1Q13351 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
KLF1Q13351 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
KLF1Q13351 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
KLF1Q13351 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KLF1Q13351 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KLF1Q13351 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KLF1Q13351 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KLF1Q13351 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KLF1Q13351 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KLF1Q13351 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KLF1Q13351 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KLF1Q13351 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KLF1Q13351 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KLF1Q13351 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KLF1Q13351 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KLF1Q13351 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KLF1Q13351 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KLF1Q13351 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KLF1Q13351 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KLF1Q13351 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KLF1Q13351 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KLF1Q13351 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KLF1Q13351 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KLF1Q13351 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KLF1Q13351 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KLF1Q13351 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KLF1Q13351 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KLF1Q13351 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KLF1Q13351 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KLF1Q13351 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
KLF1Q13351 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
KLF1Q13351 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
KLF1Q13351 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
KLF1Q13351 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KLF1Q13351 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
KLF1Q13351 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
KLF1Q13351 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
KLF1Q13351 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
KLF1Q13351 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
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