Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 DNAH12-202ENST00000351747 9542 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 KLRD1-204ENST00000381908 15549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 MIR432-201ENST00000606207 94 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.2 ms