Protein–RNA interactions for Protein: Q13042

CDC16, Cell division cycle protein 16 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC16Q13042 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CDC16Q13042 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CDC16Q13042 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CDC16Q13042 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CDC16Q13042 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CDC16Q13042 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CDC16Q13042 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CDC16Q13042 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CDC16Q13042 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CDC16Q13042 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CDC16Q13042 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CDC16Q13042 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CDC16Q13042 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CDC16Q13042 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CDC16Q13042 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CDC16Q13042 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
CDC16Q13042 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CDC16Q13042 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CDC16Q13042 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CDC16Q13042 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CDC16Q13042 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CDC16Q13042 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CDC16Q13042 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CDC16Q13042 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CDC16Q13042 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CDC16Q13042 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CDC16Q13042 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CDC16Q13042 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CDC16Q13042 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CDC16Q13042 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CDC16Q13042 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CDC16Q13042 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CDC16Q13042 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CDC16Q13042 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CDC16Q13042 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CDC16Q13042 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CDC16Q13042 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CDC16Q13042 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CDC16Q13042 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CDC16Q13042 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CDC16Q13042 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CDC16Q13042 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CDC16Q13042 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CDC16Q13042 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CDC16Q13042 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CDC16Q13042 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CDC16Q13042 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CDC16Q13042 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CDC16Q13042 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CDC16Q13042 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CDC16Q13042 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CDC16Q13042 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CDC16Q13042 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CDC16Q13042 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CDC16Q13042 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CDC16Q13042 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CDC16Q13042 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CDC16Q13042 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CDC16Q13042 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CDC16Q13042 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CDC16Q13042 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CDC16Q13042 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.08
CDC16Q13042 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
CDC16Q13042 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.08
CDC16Q13042 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
CDC16Q13042 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CDC16Q13042 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CDC16Q13042 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CDC16Q13042 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CDC16Q13042 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CDC16Q13042 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CDC16Q13042 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CDC16Q13042 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CDC16Q13042 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CDC16Q13042 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CDC16Q13042 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CDC16Q13042 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CDC16Q13042 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CDC16Q13042 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CDC16Q13042 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CDC16Q13042 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CDC16Q13042 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
CDC16Q13042 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CDC16Q13042 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CDC16Q13042 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CDC16Q13042 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
CDC16Q13042 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
CDC16Q13042 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CDC16Q13042 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CDC16Q13042 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CDC16Q13042 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CDC16Q13042 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CDC16Q13042 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CDC16Q13042 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CDC16Q13042 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CDC16Q13042 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CDC16Q13042 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CDC16Q13042 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CDC16Q13042 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CDC16Q13042 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.5 ms