Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
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RAB40BQ12829 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RAB40BQ12829 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RAB40BQ12829 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RAB40BQ12829 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RAB40BQ12829 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RAB40BQ12829 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RAB40BQ12829 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RAB40BQ12829 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RAB40BQ12829 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
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RAB40BQ12829 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RAB40BQ12829 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RAB40BQ12829 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
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RAB40BQ12829 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
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RAB40BQ12829 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
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RAB40BQ12829 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.26□□□□□ -2.21
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RAB40BQ12829 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
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RAB40BQ12829 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
RAB40BQ12829 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
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RAB40BQ12829 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
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RAB40BQ12829 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RAB40BQ12829 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
RAB40BQ12829 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RAB40BQ12829 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RAB40BQ12829 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RAB40BQ12829 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
RAB40BQ12829 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
RAB40BQ12829 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RAB40BQ12829 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RAB40BQ12829 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
RAB40BQ12829 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RAB40BQ12829 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RAB40BQ12829 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RAB40BQ12829 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
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