Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC1.21□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
SMARCB1Q12824 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SMARCB1Q12824 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
SMARCB1Q12824 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
SMARCB1Q12824 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SMARCB1Q12824 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SMARCB1Q12824 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SMARCB1Q12824 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SMARCB1Q12824 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SMARCB1Q12824 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SMARCB1Q12824 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SMARCB1Q12824 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SMARCB1Q12824 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SMARCB1Q12824 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SMARCB1Q12824 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
SMARCB1Q12824 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SMARCB1Q12824 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SMARCB1Q12824 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SMARCB1Q12824 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SMARCB1Q12824 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SMARCB1Q12824 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SMARCB1Q12824 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SMARCB1Q12824 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SMARCB1Q12824 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.21□□□□□ -2.22
SMARCB1Q12824 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
SMARCB1Q12824 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SMARCB1Q12824 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SMARCB1Q12824 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SMARCB1Q12824 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SMARCB1Q12824 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
SMARCB1Q12824 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SMARCB1Q12824 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SMARCB1Q12824 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SMARCB1Q12824 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SMARCB1Q12824 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SMARCB1Q12824 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SMARCB1Q12824 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SMARCB1Q12824 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SMARCB1Q12824 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SMARCB1Q12824 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SMARCB1Q12824 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SMARCB1Q12824 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SMARCB1Q12824 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
SMARCB1Q12824 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
SMARCB1Q12824 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SMARCB1Q12824 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SMARCB1Q12824 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
SMARCB1Q12824 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
SMARCB1Q12824 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
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