Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
HOXC5Q00444 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
HOXC5Q00444 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
HOXC5Q00444 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
HOXC5Q00444 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
HOXC5Q00444 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
HOXC5Q00444 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
HOXC5Q00444 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
HOXC5Q00444 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
HOXC5Q00444 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
HOXC5Q00444 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC0.43□□□□□ -2.34
HOXC5Q00444 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
HOXC5Q00444 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
HOXC5Q00444 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
HOXC5Q00444 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
HOXC5Q00444 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC0.43□□□□□ -2.34
HOXC5Q00444 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
HOXC5Q00444 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
HOXC5Q00444 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
HOXC5Q00444 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
HOXC5Q00444 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
HOXC5Q00444 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
HOXC5Q00444 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
HOXC5Q00444 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
HOXC5Q00444 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
HOXC5Q00444 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
HOXC5Q00444 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
HOXC5Q00444 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.42□□□□□ -2.34
HOXC5Q00444 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
HOXC5Q00444 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC0.42□□□□□ -2.34
HOXC5Q00444 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
HOXC5Q00444 AC091917.1-201ENST00000506330 566 ntTSL 4 BASIC0.42□□□□□ -2.34
HOXC5Q00444 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
HOXC5Q00444 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
HOXC5Q00444 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
HOXC5Q00444 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
HOXC5Q00444 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
HOXC5Q00444 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
HOXC5Q00444 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
HOXC5Q00444 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC0.42□□□□□ -2.34
HOXC5Q00444 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
HOXC5Q00444 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
HOXC5Q00444 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
HOXC5Q00444 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
HOXC5Q00444 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
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HOXC5Q00444 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
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HOXC5Q00444 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC0.41□□□□□ -2.34
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HOXC5Q00444 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
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HOXC5Q00444 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
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HOXC5Q00444 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
HOXC5Q00444 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
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HOXC5Q00444 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
HOXC5Q00444 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.4□□□□□ -2.35
HOXC5Q00444 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
HOXC5Q00444 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
HOXC5Q00444 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC0.39□□□□□ -2.35
HOXC5Q00444 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.39□□□□□ -2.35
HOXC5Q00444 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
HOXC5Q00444 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
HOXC5Q00444 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
HOXC5Q00444 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
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