Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 AC099063.1-201ENST00000437128 324 ntTSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPRBP23467 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
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