Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
LRRTM2O43300 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
LRRTM2O43300 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
LRRTM2O43300 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
LRRTM2O43300 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
LRRTM2O43300 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
LRRTM2O43300 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
LRRTM2O43300 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
LRRTM2O43300 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
LRRTM2O43300 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
LRRTM2O43300 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
LRRTM2O43300 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
LRRTM2O43300 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
LRRTM2O43300 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
LRRTM2O43300 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
LRRTM2O43300 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
LRRTM2O43300 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
LRRTM2O43300 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
LRRTM2O43300 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
LRRTM2O43300 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
LRRTM2O43300 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
LRRTM2O43300 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
LRRTM2O43300 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
LRRTM2O43300 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
LRRTM2O43300 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
LRRTM2O43300 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
LRRTM2O43300 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
LRRTM2O43300 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
LRRTM2O43300 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
LRRTM2O43300 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
LRRTM2O43300 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.67□□□□□ -2.14
LRRTM2O43300 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
LRRTM2O43300 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
LRRTM2O43300 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
LRRTM2O43300 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
LRRTM2O43300 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
LRRTM2O43300 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
LRRTM2O43300 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
LRRTM2O43300 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
LRRTM2O43300 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
LRRTM2O43300 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
LRRTM2O43300 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
LRRTM2O43300 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
LRRTM2O43300 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
LRRTM2O43300 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
LRRTM2O43300 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
LRRTM2O43300 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
LRRTM2O43300 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
LRRTM2O43300 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
LRRTM2O43300 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
LRRTM2O43300 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
LRRTM2O43300 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
LRRTM2O43300 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
LRRTM2O43300 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
LRRTM2O43300 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
LRRTM2O43300 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
LRRTM2O43300 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
LRRTM2O43300 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
LRRTM2O43300 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
LRRTM2O43300 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC1.64□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
LRRTM2O43300 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
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