Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.25□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC0.25□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.24□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.24□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC0.24□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC0.24□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC0.24□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC0.24□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC0.23□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC0.23□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC0.22□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC0.22□□□□□ -2.37
IRGMA1A4Y4 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.6 ms