Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC-0.69□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC-0.69□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC010376.1-201ENST00000522101 334 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC-0.7□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC-0.7□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-180P-201ENST00000516697 61 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC-0.7□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC-0.7□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC-0.71□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1102P-201ENST00000516149 96 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC-0.71□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR4788-201ENST00000639104 80 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTCO3P27-201ENST00000514397 196 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF92P2-201ENST00000600543 1059 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC-0.72□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL355143.1-201ENST00000407101 841 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC114878.1-201ENST00000441166 358 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC-0.73□□□□□ -2.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP003386.1-201ENST00000526509 504 ntTSL 3 BASIC-0.73□□□□□ -2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.2 ms