Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms