Protein–RNA interactions for Protein: S4R181

Ccdc166, Coiled-coil domain-containing 166, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc166S4R181 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc166S4R181 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc166S4R181 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc166S4R181 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc166S4R181 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc166S4R181 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc166S4R181 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc166S4R181 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc166S4R181 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc166S4R181 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc166S4R181 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc166S4R181 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc166S4R181 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc166S4R181 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc166S4R181 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc166S4R181 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc166S4R181 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc166S4R181 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc166S4R181 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc166S4R181 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc166S4R181 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc166S4R181 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc166S4R181 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc166S4R181 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc166S4R181 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc166S4R181 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc166S4R181 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc166S4R181 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc166S4R181 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc166S4R181 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc166S4R181 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc166S4R181 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc166S4R181 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc166S4R181 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc166S4R181 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc166S4R181 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc166S4R181 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc166S4R181 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc166S4R181 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc166S4R181 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc166S4R181 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc166S4R181 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc166S4R181 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc166S4R181 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc166S4R181 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc166S4R181 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc166S4R181 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc166S4R181 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc166S4R181 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc166S4R181 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc166S4R181 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc166S4R181 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc166S4R181 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc166S4R181 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc166S4R181 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc166S4R181 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc166S4R181 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc166S4R181 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc166S4R181 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc166S4R181 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc166S4R181 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc166S4R181 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc166S4R181 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc166S4R181 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc166S4R181 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc166S4R181 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc166S4R181 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc166S4R181 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc166S4R181 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc166S4R181 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc166S4R181 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc166S4R181 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc166S4R181 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc166S4R181 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc166S4R181 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc166S4R181 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc166S4R181 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc166S4R181 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc166S4R181 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc166S4R181 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc166S4R181 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc166S4R181 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc166S4R181 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc166S4R181 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc166S4R181 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc166S4R181 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc166S4R181 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc166S4R181 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc166S4R181 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc166S4R181 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc166S4R181 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc166S4R181 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc166S4R181 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc166S4R181 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc166S4R181 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc166S4R181 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc166S4R181 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc166S4R181 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc166S4R181 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms