Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T2

Thbs4, Thrombospondin-4, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs4Q9Z1T2 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Thbs4Q9Z1T2 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Thbs4Q9Z1T2 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Thbs4Q9Z1T2 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Thbs4Q9Z1T2 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Thbs4Q9Z1T2 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Thbs4Q9Z1T2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Thbs4Q9Z1T2 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Thbs4Q9Z1T2 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Thbs4Q9Z1T2 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Thbs4Q9Z1T2 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Thbs4Q9Z1T2 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Thbs4Q9Z1T2 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Thbs4Q9Z1T2 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Thbs4Q9Z1T2 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Thbs4Q9Z1T2 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Thbs4Q9Z1T2 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Thbs4Q9Z1T2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Thbs4Q9Z1T2 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Thbs4Q9Z1T2 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Thbs4Q9Z1T2 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Thbs4Q9Z1T2 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Thbs4Q9Z1T2 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Thbs4Q9Z1T2 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Thbs4Q9Z1T2 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Thbs4Q9Z1T2 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Thbs4Q9Z1T2 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Thbs4Q9Z1T2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Thbs4Q9Z1T2 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Thbs4Q9Z1T2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Thbs4Q9Z1T2 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Thbs4Q9Z1T2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Thbs4Q9Z1T2 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Thbs4Q9Z1T2 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Thbs4Q9Z1T2 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Thbs4Q9Z1T2 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Thbs4Q9Z1T2 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Thbs4Q9Z1T2 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Thbs4Q9Z1T2 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Thbs4Q9Z1T2 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Thbs4Q9Z1T2 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Thbs4Q9Z1T2 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Thbs4Q9Z1T2 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Thbs4Q9Z1T2 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Thbs4Q9Z1T2 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Thbs4Q9Z1T2 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Thbs4Q9Z1T2 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Thbs4Q9Z1T2 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Thbs4Q9Z1T2 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Thbs4Q9Z1T2 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Thbs4Q9Z1T2 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Thbs4Q9Z1T2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Thbs4Q9Z1T2 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Thbs4Q9Z1T2 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Thbs4Q9Z1T2 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Thbs4Q9Z1T2 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Thbs4Q9Z1T2 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Thbs4Q9Z1T2 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Thbs4Q9Z1T2 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Thbs4Q9Z1T2 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Thbs4Q9Z1T2 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Thbs4Q9Z1T2 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Thbs4Q9Z1T2 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Thbs4Q9Z1T2 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Thbs4Q9Z1T2 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Thbs4Q9Z1T2 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Thbs4Q9Z1T2 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Thbs4Q9Z1T2 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Thbs4Q9Z1T2 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Thbs4Q9Z1T2 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Thbs4Q9Z1T2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Thbs4Q9Z1T2 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Thbs4Q9Z1T2 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Thbs4Q9Z1T2 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Thbs4Q9Z1T2 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Thbs4Q9Z1T2 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Thbs4Q9Z1T2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Thbs4Q9Z1T2 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Thbs4Q9Z1T2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Thbs4Q9Z1T2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Thbs4Q9Z1T2 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Thbs4Q9Z1T2 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Thbs4Q9Z1T2 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Thbs4Q9Z1T2 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Thbs4Q9Z1T2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Thbs4Q9Z1T2 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Thbs4Q9Z1T2 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Thbs4Q9Z1T2 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Thbs4Q9Z1T2 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Thbs4Q9Z1T2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Thbs4Q9Z1T2 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Thbs4Q9Z1T2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Thbs4Q9Z1T2 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Thbs4Q9Z1T2 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Thbs4Q9Z1T2 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Thbs4Q9Z1T2 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Thbs4Q9Z1T2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Thbs4Q9Z1T2 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Thbs4Q9Z1T2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Thbs4Q9Z1T2 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms