Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVL1

Ap4s1, AP-4 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4s1Q9WVL1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ap4s1Q9WVL1 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms