Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV27

Atp1a4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a4Q9WV27 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp1a4Q9WV27 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms