Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Psmb3Q9R1P1 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Psmb3Q9R1P1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Psmb3Q9R1P1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Psmb3Q9R1P1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Psmb3Q9R1P1 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Psmb3Q9R1P1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Psmb3Q9R1P1 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Psmb3Q9R1P1 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Psmb3Q9R1P1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Psmb3Q9R1P1 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Psmb3Q9R1P1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Psmb3Q9R1P1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Psmb3Q9R1P1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Psmb3Q9R1P1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Psmb3Q9R1P1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Psmb3Q9R1P1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Psmb3Q9R1P1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Psmb3Q9R1P1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Psmb3Q9R1P1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Psmb3Q9R1P1 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Psmb3Q9R1P1 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Psmb3Q9R1P1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Psmb3Q9R1P1 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Psmb3Q9R1P1 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Psmb3Q9R1P1 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Psmb3Q9R1P1 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Psmb3Q9R1P1 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Psmb3Q9R1P1 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Psmb3Q9R1P1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Psmb3Q9R1P1 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Psmb3Q9R1P1 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Psmb3Q9R1P1 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Psmb3Q9R1P1 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Psmb3Q9R1P1 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Psmb3Q9R1P1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Psmb3Q9R1P1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Psmb3Q9R1P1 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Psmb3Q9R1P1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Psmb3Q9R1P1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Psmb3Q9R1P1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Psmb3Q9R1P1 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Psmb3Q9R1P1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Psmb3Q9R1P1 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Psmb3Q9R1P1 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Psmb3Q9R1P1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Psmb3Q9R1P1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Psmb3Q9R1P1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Psmb3Q9R1P1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Psmb3Q9R1P1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Psmb3Q9R1P1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Psmb3Q9R1P1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Psmb3Q9R1P1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Psmb3Q9R1P1 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Psmb3Q9R1P1 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Psmb3Q9R1P1 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Psmb3Q9R1P1 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Psmb3Q9R1P1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Psmb3Q9R1P1 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Psmb3Q9R1P1 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Psmb3Q9R1P1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Psmb3Q9R1P1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Psmb3Q9R1P1 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Psmb3Q9R1P1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Psmb3Q9R1P1 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Psmb3Q9R1P1 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psmb3Q9R1P1 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psmb3Q9R1P1 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psmb3Q9R1P1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psmb3Q9R1P1 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psmb3Q9R1P1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psmb3Q9R1P1 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psmb3Q9R1P1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psmb3Q9R1P1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psmb3Q9R1P1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psmb3Q9R1P1 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psmb3Q9R1P1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psmb3Q9R1P1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psmb3Q9R1P1 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psmb3Q9R1P1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Psmb3Q9R1P1 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psmb3Q9R1P1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psmb3Q9R1P1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psmb3Q9R1P1 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psmb3Q9R1P1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psmb3Q9R1P1 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psmb3Q9R1P1 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psmb3Q9R1P1 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Psmb3Q9R1P1 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Psmb3Q9R1P1 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Psmb3Q9R1P1 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Psmb3Q9R1P1 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Psmb3Q9R1P1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Psmb3Q9R1P1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Psmb3Q9R1P1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Psmb3Q9R1P1 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Psmb3Q9R1P1 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Psmb3Q9R1P1 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Psmb3Q9R1P1 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Psmb3Q9R1P1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.7 ms