Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM3

Clcf1, Cardiotrophin-like cytokine factor 1, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcf1Q9QZM3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Clcf1Q9QZM3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clcf1Q9QZM3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clcf1Q9QZM3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clcf1Q9QZM3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clcf1Q9QZM3 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clcf1Q9QZM3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clcf1Q9QZM3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clcf1Q9QZM3 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Clcf1Q9QZM3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clcf1Q9QZM3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clcf1Q9QZM3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clcf1Q9QZM3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clcf1Q9QZM3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clcf1Q9QZM3 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clcf1Q9QZM3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clcf1Q9QZM3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clcf1Q9QZM3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clcf1Q9QZM3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clcf1Q9QZM3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clcf1Q9QZM3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clcf1Q9QZM3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clcf1Q9QZM3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clcf1Q9QZM3 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clcf1Q9QZM3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clcf1Q9QZM3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clcf1Q9QZM3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clcf1Q9QZM3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clcf1Q9QZM3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clcf1Q9QZM3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clcf1Q9QZM3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clcf1Q9QZM3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clcf1Q9QZM3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clcf1Q9QZM3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clcf1Q9QZM3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clcf1Q9QZM3 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clcf1Q9QZM3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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