Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Homer2Q9QWW1 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Homer2Q9QWW1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms