Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkd2l2Q9JLG4 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms