Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Irx5Q9JKQ4 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Irx5Q9JKQ4 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms