Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms