Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stx12Q9ER00 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stx12Q9ER00 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stx12Q9ER00 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stx12Q9ER00 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stx12Q9ER00 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stx12Q9ER00 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stx12Q9ER00 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stx12Q9ER00 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stx12Q9ER00 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stx12Q9ER00 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stx12Q9ER00 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stx12Q9ER00 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stx12Q9ER00 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stx12Q9ER00 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stx12Q9ER00 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stx12Q9ER00 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stx12Q9ER00 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stx12Q9ER00 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stx12Q9ER00 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stx12Q9ER00 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stx12Q9ER00 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stx12Q9ER00 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stx12Q9ER00 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stx12Q9ER00 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stx12Q9ER00 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stx12Q9ER00 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stx12Q9ER00 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stx12Q9ER00 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stx12Q9ER00 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Stx12Q9ER00 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Stx12Q9ER00 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms